从实验室工作流程来看，微生物实验室可分为样品保存、样品前处理、过程分析、清洗灭菌四个流程，不同的工作流程需要不同的仪器。

一、样品保存

1、超低温冰箱：低温保存疫苗、菌种、生物样本等

2、液氮罐：长期活性保存疫苗、菌毒种、细胞

3、药品冷藏箱：用于冷藏保存药品、试剂、生物制品和疫苗

二、样品前处理

1、移液器：定量转移液体的器具

2、离心机:液固或液液颗粒分离

3、冻干机:冻结的水分子直接升华水蒸气

4、均质仪:提取样品中DNA/RNA/蛋白质

5、培养箱:培养微生物、植物和动物细胞

6、生物安全柜:实验操作中空气净化负压安全装置

7、超净工作台:局部工作区域洁净度

三、过程分析

1、PCR仪：用于传染病的诊断、基因复制以及亲子鉴定

2、酶标仪：酶联免疫吸附试验的专用仪器

3、核酸提取仪：核酸提取试剂自动完成样本核酸提取

4、暗箱式紫外分析仪：于核酸、蛋白电泳凝胶，薄层层板结果的观察分析

5、电泳仪：用于DNA测序

四、清洗灭菌

1、高压灭菌锅：实验前后杀菌

2、超声波清洗机：清洗实验器具及玻璃器皿

以上仪器同样适用于微生物、细胞生物、分子生物、组织培养、PCR实验室。